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Recipe Compare
把同一个 UK Biobank 表型的多份已发表定义并排摆开：用了哪些来源、覆盖了哪些编码、逐条规则原文，以及各自出自哪篇研究。
表型
36 / 36ukbflow 0.4.0 · 2026-08-14
Stroke
6 来源 · 0 共有 ｜ 17 编码 · 0 共有来源
| stroke | lu | mu | nyberg | qin | vazquez | yun | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 自报疾病selfreport | · | ✓ | · | · | · | · | · |
| HES 住院 ICD-10hes | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | · | ✓ |
| HES 住院 ICD-9hes_icd9 | · | · | · | ✓ | · | · | ✓ |
| 死亡登记death | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | · | · |
| First Occurrencefirst_occurrence | · | ✓ | · | · | · | · | · |
| 算法判定结局algorithm | · | · | · | · | · | ✓ | · |
这一层只答「用了哪些来源」。槽内规则条数不填在这里 —— 一条 hes 规则可以装三十个编码，一条 first_occurrence 规则只装一个字段，两者的条数不可比；覆盖多少编码看下面一层。
编码
| stroke | lu | mu | nyberg | qin | vazquez | yun | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ICD-10I60 | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | · | ✓ |
| I61 | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | · | ✓ |
| I62 | · | ✓ | · | · | ✓ | · | ✓ |
| I63 | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | · | ✓ |
| I64 | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | · | ✓ |
| ICD-9430 | · | · | · | ✓ | · | · | ✓ |
| 431 | · | · | · | ✓ | · | · | ✓ |
| 432 | · | · | · | · | · | · | ✓ |
| 433 | · | · | · | ✓ | · | · | ✓ |
| 434 | · | · | · | ✓ | · | · | ✓ |
| 436 | · | · | · | ✓ | · | · | ✓ |
| First Occurrence131360 | · | ✓ | · | · | · | · | · |
| 131362 | · | ✓ | · | · | · | · | · |
| 131364 | · | ✓ | · | · | · | · | · |
| 131366 | · | ✓ | · | · | · | · | · |
| 131368 | · | ✓ | · | · | · | · | · |
| ADO42006 | · | · | · | · | · | ✓ | · |
按类目归并，所以逐条枚举与前缀写法能对上。match: regex 的规则不占自己的行，而是拿模式去筛其他定义列出的编码；prefix 与 exact 的差别见下方规则原文。
规则
| stroke | hes | icd10: I60, I61, I63, I64 · match: prefix |
| death | icd10: I60, I61, I63, I64 · match: prefix | |
| lu | selfreport | field: noncancer · regex: ^(stroke|subarachnoid haemorrhage|brain haemorrhage|ischaemic stroke)$ |
| hes | icd10: I60.0, I60.1, I60.2, I60.3, I60.4, I60.5, I60.6, I60.7, I60.8, I60.9, I61.0, I61.1, I61.2, I61.3, I61.4, I61.5, I61.6, I61.8, I61.9, I62.0, I62.1, I62.9, I63.0, I63.1, I63.2, I63.3, I63.4, I63.5, I63.6, I63.8, I63.9, I64 · match: prefix | |
| death | icd10: I60.0, I60.1, I60.2, I60.3, I60.4, I60.5, I60.6, I60.7, I60.8, I60.9, I61.0, I61.1, I61.2, I61.3, I61.4, I61.5, I61.6, I61.8, I61.9, I62.0, I62.1, I62.9, I63.0, I63.1, I63.2, I63.3, I63.4, I63.5, I63.6, I63.8, I63.9, I64 · match: prefix | |
| first_occurrence | field: 131360 | |
| field: 131362 | ||
| field: 131364 | ||
| field: 131366 | ||
| field: 131368 | ||
| mu | hes | icd10: I60, I60.0, I60.1, I60.2, I60.3, I60.4, I60.5, I60.6, I60.7, I60.8, I60.9, I61, I61.0, I61.1, I61.2, I61.3, I61.4, I61.5, I61.6, I61.8, I61.9, I63, I63.0, I63.1, I63.2, I63.3, I63.4, I63.5, I63.6, I63.8, I63.9, I64, I64.0, I64.1, I64.9 · match: exact |
| death | icd10: I60, I60.0, I60.1, I60.2, I60.3, I60.4, I60.5, I60.6, I60.7, I60.8, I60.9, I61, I61.0, I61.1, I61.2, I61.3, I61.4, I61.5, I61.6, I61.8, I61.9, I63, I63.0, I63.1, I63.2, I63.3, I63.4, I63.5, I63.6, I63.8, I63.9, I64, I64.0, I64.1, I64.9 · match: exact | |
| nyberg | hes | icd10: I60, I61, I63, I64 · match: prefix |
| hes_icd9 | icd9: 430, 431, 433, 434, 436 · match: prefix | |
| death | icd10: I60, I61, I63, I64 · match: prefix | |
| qin | hes | icd10: I60, I61, I62, I63, I64 · match: prefix |
| death | icd10: I60, I61, I62, I63, I64 · match: prefix | |
| vazquez | algorithm | field: 42006 |
| yun | hes | icd10: I60, I61, I62, I63, I64 · match: prefix |
| hes_icd9 | icd9: 430, 431, 432, 433, 434, 436 · match: prefix |
出处
strokev2 · 2026-07-13- Provenance: Zisou et al. 2026, Int J Epidemiol, DOI 10.1093/ije/dyag014. Stroke, UK Biobank.
stroke_luv2 · 2026-07-13- Provenance: Lu et al. 2026, BMC Medicine, DOI 10.1186/s12916-026-04909-6. Stroke, UK Biobank (Additional file 1: Table S2).
stroke_muv1 · 2026-07-13- Provenance: Mu et al. 2026, BMC Medicine, DOI 10.1186/s12916-026-04701-6. Stroke, UK Biobank (Table S1).
stroke_nybergv2 · 2026-07-13- Provenance: Nyberg et al. 2025, Lancet Public Health, DOI 10.1016/S2468-2667(24)00300-1 (PMID 39909687). Stroke, UK Biobank.
stroke_qinv1 · 2026-07-16- Provenance: Qin et al. 2025, BMC Medicine, DOI 10.1186/s12916-025-04546-5. Stroke, UK Biobank (Table S5).
stroke_vazquezv2 · 2026-07-13- Provenance: Vazquez-Fernandez et al. 2026, BMC Medicine, DOI 10.1186/s12916-026-05010-8. Stroke, UK Biobank.
stroke_yunv1 · 2026-07-15- Provenance: Yun et al. 2026, eClinicalMedicine, DOI 10.1016/j.eclinm.2026.103769 (PMID 41660364). Stroke, UK Biobank.
说明
- 这里比的是什么
- 同一个表型名下的多份配方，各自复现一篇已发表的 UK Biobank 研究是怎么把这个表型 操作化的。它们共用
label、以id区分，因为它们确实是同一个表型的不同定义。 - 三层
- 来源看用了哪些数据源，编码看覆盖了哪些码，规则是配方原文。只看第一层会以为两份定义一样，只看第二层会漏掉
match模式的差别，只看第三层则一屏放不下七列。 - 不做语义归一
- 编码那一层按三字符归并，是为了让「I60 前缀」和「I60.0–I60.9 逐条枚举」落在同一行。 但
prefix与exact是否等价，取决于 HES 里实际出现过哪些码，这个页面不替读者判断 —— 它把两种写法都摆出来。 - 共有
- 「共有」指当前选中的全部定义都用了这个来源 / 覆盖了这个编码。取消勾选任何一份定义， 这个数都会跟着变 —— 它衡量的是选中的这一组，不是配方库整体。
- 数据从哪来
scripts/build-recipe-catalog.R从 ukbflow 包里读recipe_get()规范化后的对象，生成一份快照。 读的不是 YAML 原文：手写文件带注释、槽的写法也不完全一致，规范化之后才能逐条比较。 要引用某条定义，以包内的文件为准。