Tessera
作图用的素材：配色，以及试代码、试图形用的现成数据。配色本身在 R 包 biopalette 里做，这里查到的名字就是 R 里要敲的名字。
15套配色113 个色值
17个数据集144.8 万 行
21张可视化65 张成图
30个绘图工具包和网页工具
形态
53 / 53
bcell_atlasOrange category · Coral category · Green category · Purple category · Slate-blue category · Ochre category · Blue-grey category定性7 色bcell_atlas2IgA coral · Light coral · Neutral midpoint · Light teal · IgG teal发散5 色bcell_clustersc05_classical–Bm_GPR183 · c01_Bn_TCL1A · c17_PC_IGHA · c15_cycling_ASC · c12_Bgc_LZ-like · c04_classical–Bm_TXNIP · c06_Bm_stress-response · c07_Bm_IFN-response · c08_ABC_FCRL4 · c09_ABC_FGR · c10_Bm_TCL1A · c11_pre-GC · c02_Bn_NR4A2 · c03_Bn_IFN-response · c16_PC_IGHG · c18_early–PC_MS4A1^low · c19_early–PC_LTB · c20_early–PC_RGS13 · c14_Bm_activated-cycling · c13_Bgc_DZ-like定性20 色gwas_manhattanTessera 确定性模拟（manhattan recipe）Toy6,000 × 4pbmc5k_donor4_cluster_de10x Genomics 5k Human PBMCs Donor 4（Cell Ranger 9.0.0）Toy4.6 万 × 12pbmc5k_donor4_embeddings10x Genomics 5k Human PBMCs Donor 4（Cell Ranger 9.0.0）Toy4,413 × 6cancer_mosaicHCC · PAAD · OV-FTC · KIDNEY · MYE · ESCA · STAD · CRC · THCA · LUNG · LUCEC · MEL · BRCA · LYM · NPC定性15 色heat_light定性2 色lactate_stepsDevelopment of the LM.SIG · Immunotherapy prediction · Survival prognostication · Potential therapeutic targets · Experimental validation of LDHA定性5 色tam_pastelFN1⁺ TAM · NLRP3⁺ TAM · VCAN⁺ TAM · INHBA⁺ TAM · ISG15⁺ TAM · SPP1⁺ TAM定性6 色lung_survivalR survival::lung（North Central Cancer Treatment Group）Toy228 × 6population_age_compositionTessera 确定性模拟（percentage_stacked recipe）Toy1,208 × 3
venn2–3 个向量，或一个以集合名命名的向量列表构成2 张airqualityR datasets::airquality（New York, 1973）Toy153 × 6
bar原始计数只需 1 个分类变量；已有柱高时再加 1 个非负数值；分组或堆叠时再加 1 个分类变量柱状6 张
box1 个分类变量 + 1 个连续数值变量分布4 张
choropleth_map区域标识 + 连续数值；边界数据另外取地图2 张
density1 个连续数值变量（可选：再加 1 个分组变量）分布5 张
grouped_scatter2 个连续变量，同一批观测；可选 1 个分组变量散点5 张hair_eye_colorR datasets::HairEyeColorToy32 × 4irisR datasets::iris（Anderson, 1935；Fisher, 1936）Toy150 × 5mitonuclear_blue渐进6 色mitonuclear_orange渐进6 色mtcarsR datasets::mtcars（Motor Trend US，1974）Toy32 × 12
multi_line时间或有序位置 + 连续数值；多序列时再加 1 个分组变量折线4 张orangeR datasets::OrangeToy35 × 3
pie1 个分类变量；或 1 个分类变量 + 1 个非负计数变量构成4 张plant_growthR datasets::PlantGrowth（Dobson, 1983）Toy30 × 2
forest每行一个效应量 —— 点估计 + 置信区间上下限，外加要一起显示的文本列误差棒4 张
sankey一张边表 —— 每行三列：从哪、到哪、多少流向2 张
scatter_fit2 个数值变量，同一批观测（可选：再加 1 个分组变量）散点2 张
tableone一份个体级数据 —— 每行一个人，若干列变量，外加一个分组列表格5 张hm3_snplistZenodo 10.5281/zenodo.7773502（Alkes Group w_hm3.snplist）生信121.7 万 × 3nyc_taxi_recordNYC TLC Yellow Taxi Trip Records（2024-10）交通1,000 × 15gene_ref_humanEnsembl（经 evanverse::download_gene_ref）生信9.2 万 × 12gene_ref_mouseEnsembl（经 evanverse::download_gene_ref）生信7.9 万 × 12economy_countriesWorld Bank WDI + REST Countries经济217 × 17babelMast_KIT · pDC_LILRA4 · cDC1_CLEC9A · cDC2_CD1C · cDC3_LAMP3 · Mono_CD14 · Mono_CD16 · Monolike_FCN1 · Macro_PPARG · Macro_ISG15 · Macro_C1QC · Macro_SPP1 · Myeloid_MKI67 · Mono_CD14CD16 · Macro_VCAN · Macro_CX3CR1 · Macro_FN1 · Macro_GPNMB · Macro_INHBA · Macro_IL1B · Macro_NLRP3定性21 色gene_red黑 · 绯红定性2 色three_bodycDC1_CLEC9A · cDC2_CD1C · cDC3_LAMP3定性3 色walter_white天蓝 · 淡蓝灰 · 冷白 · 灰绿 · 深橄榄发散5 色walter_white2天青 · 橄榄绿 · 房车米 · 沙漠橙 · 烟粉定性5 色walter_white3深玫瑰 · 藕粉 · 暖米 · 淡灰绿 · 森林绿发散5 色
correlation_heatmap3 个以上数值变量，同一批样本热图2 张
expression_heatmap数值矩阵（行 = 特征、列 = 样本）+ 可选的行/列注释表热图3 张
manhattan标记名 + 染色体 + 位置 + P 值，四列散点2 张
percentage_stacked时间 + 分类 + 数值，三列长表构成2 张
point_errorbar分类变量 + 点估计 + 误差范围（已汇总的表，不是原始观测）误差棒2 张
scatter_errorbar每行一项研究：x 的估计和上下限 + y 的估计和上下限误差棒2 张
survival_curve随访时间 + 事件状态（0/1）+ 分组变量生存曲线2 张
treemap1 个分类变量 + 1 个非负数值变量（可选：再加 1 个分组变量）构成2 张
violin1 个分类变量 + 1 个数值变量分布3 张weather_citiesOpen-Meteo Archive API气象600 × 6
venn2–3 个向量，或一个以集合名命名的向量列表构成2 张airqualityR datasets::airquality（New York, 1973）Toy153 × 6bar原始计数只需 1 个分类变量；已有柱高时再加 1 个非负数值；分组或堆叠时再加 1 个分类变量柱状6 张box1 个分类变量 + 1 个连续数值变量分布4 张choropleth_map区域标识 + 连续数值；边界数据另外取地图2 张density1 个连续数值变量（可选：再加 1 个分组变量）分布5 张grouped_scatter2 个连续变量，同一批观测；可选 1 个分组变量散点5 张hair_eye_colorR datasets::HairEyeColorToy32 × 4irisR datasets::iris（Anderson, 1935；Fisher, 1936）Toy150 × 5mitonuclear_blue渐进6 色mitonuclear_orange渐进6 色mtcarsR datasets::mtcars（Motor Trend US，1974）Toy32 × 12multi_line时间或有序位置 + 连续数值；多序列时再加 1 个分组变量折线4 张orangeR datasets::OrangeToy35 × 3pie1 个分类变量；或 1 个分类变量 + 1 个非负计数变量构成4 张plant_growthR datasets::PlantGrowth（Dobson, 1983）Toy30 × 2forest每行一个效应量 —— 点估计 + 置信区间上下限，外加要一起显示的文本列误差棒4 张sankey一张边表 —— 每行三列：从哪、到哪、多少流向2 张scatter_fit2 个数值变量，同一批观测（可选：再加 1 个分组变量）散点2 张tableone一份个体级数据 —— 每行一个人，若干列变量，外加一个分组列表格5 张hm3_snplistZenodo 10.5281/zenodo.7773502（Alkes Group w_hm3.snplist）生信121.7 万 × 3nyc_taxi_recordNYC TLC Yellow Taxi Trip Records（2024-10）交通1,000 × 15gene_ref_humanEnsembl（经 evanverse::download_gene_ref）生信9.2 万 × 12gene_ref_mouseEnsembl（经 evanverse::download_gene_ref）生信7.9 万 × 12economy_countriesWorld Bank WDI + REST Countries经济217 × 17babelMast_KIT · pDC_LILRA4 · cDC1_CLEC9A · cDC2_CD1C · cDC3_LAMP3 · Mono_CD14 · Mono_CD16 · Monolike_FCN1 · Macro_PPARG · Macro_ISG15 · Macro_C1QC · Macro_SPP1 · Myeloid_MKI67 · Mono_CD14CD16 · Macro_VCAN · Macro_CX3CR1 · Macro_FN1 · Macro_GPNMB · Macro_INHBA · Macro_IL1B · Macro_NLRP3定性21 色gene_red黑 · 绯红定性2 色three_bodycDC1_CLEC9A · cDC2_CD1C · cDC3_LAMP3定性3 色walter_white天蓝 · 淡蓝灰 · 冷白 · 灰绿 · 深橄榄发散5 色walter_white2天青 · 橄榄绿 · 房车米 · 沙漠橙 · 烟粉定性5 色walter_white3深玫瑰 · 藕粉 · 暖米 · 淡灰绿 · 森林绿发散5 色correlation_heatmap3 个以上数值变量，同一批样本热图2 张expression_heatmap数值矩阵（行 = 特征、列 = 样本）+ 可选的行/列注释表热图3 张manhattan标记名 + 染色体 + 位置 + P 值，四列散点2 张percentage_stacked时间 + 分类 + 数值，三列长表构成2 张point_errorbar分类变量 + 点估计 + 误差范围（已汇总的表，不是原始观测）误差棒2 张scatter_errorbar每行一项研究：x 的估计和上下限 + y 的估计和上下限误差棒2 张survival_curve随访时间 + 事件状态（0/1）+ 分组变量生存曲线2 张treemap1 个分类变量 + 1 个非负数值变量（可选：再加 1 个分组变量）构成2 张violin1 个分类变量 + 1 个数值变量分布3 张weather_citiesOpen-Meteo Archive API气象600 × 6