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AI, Machine Learning, Neural Networks, and Deep LearningStatisticsAI 是构建能够执行感知、推理、学习或生成等智能任务的系统这一宽泛领域；machine learning、neural network 与 deep learning 是其中层层嵌套但不能互换的概念。artificial-intelligence · machine-learning · neural-networksAortic AneurysmClinicalAortic aneurysm 是主动脉局部异常扩张。主动脉是从心脏向全身输送富氧血液的最大动脉；当某一段主动脉壁变弱，在血流压力下向外膨出，就形成 aneurysm。aortic-aneurysm · abdominal-aortic-aneurysm · thoracic-aortic-aneurysmApoptosisCell BiologyApoptosis 是一种受严格调控的 programmed cell death，典型特征包括细胞皱缩、chromatin condensation、membrane blebbing、DNA fragmentation 与 caspase activation。apoptosis · cell-death · regulated-cell-deathCancer-Associated FibroblastCancerCancer-associated fibroblasts（CAFs）是 tumour microenvironment 中具有多种 activated fibroblast-like states 的 stromal cells。cancer-associated-fibroblast · caf · tumor-microenvironmentCell AnnotationOmicsCell annotation 是依据表达特征、marker、参考图谱和生物学背景，为单细胞或细胞群赋予 cell type 或 cell state 身份的过程。single-cell · scrna-seq · cell-typecfDNACancerCell-free DNA（cfDNA）是存在于血液等体液中的细胞外 DNA；其中来源于肿瘤的部分称为 circulating tumor DNA（ctDNA）。cfdna · ctdna · liquid-biopsyCohort Study vs Case-Control StudyStudy DesignCohort study 从来源人群与暴露出发观察结局，case-control study 则按结局抽取病例和对照，再比较既往暴露。cohort-study · case-control-study · observational-studyConfusion MatrixStatisticsConfusion matrix 是把分类模型的 predicted labels 与 true labels 交叉列出的表格，是理解 accuracy、precision、recall 与 specificity 的基础。confusion-matrix · classification · model-evaluationCopy Number VariationGenomicsCopy number variation（CNV）是相对于预期 copy number 出现的基因组 DNA 片段 gain 或 loss。cnv · copy-number-variation · cancerCpG IslandGenomicsCpG island 是 CpG dinucleotides 高度富集的基因组区域，常位于 gene promoter 附近，其 methylation 状态与转录调控密切相关。cpg-island · cpg-site · dna-methylationCSS 样式与布局笔记Programming本笔记介绍 CSS 的主要功能、基本语法、选择器与声明块、盒模型、Flexbox 与 Grid 布局、响应式设计，以及过渡和动画等前端样式基础。CSS · 前端开发 · 样式表Cycling and Noncycling CellsCell BiologyCycling cells 指当前处于 active cell cycle 的细胞。它们正在准备 DNA replication、进行 DNA synthesis、准备 mitosis，或处在细胞分裂相关阶段。single-cell · cell-cycle · cell-stateDeclaration of HelsinkiStudy DesignDeclaration of Helsinki 是世界医学会制定的涉及人类参与者医学研究伦理原则，涵盖知情同意、风险获益、伦理审查、隐私和结果公开。declaration-of-helsinki · research-ethics · informed-consentDendritic CellsImmunologyDendritic cells（DCs）是专业 antigen-presenting cells，负责摄取和加工 antigen，并通过 MHC 将其呈递给 T cells。dendritic-cell · antigen-presentation · cdc1DictionaryProgrammingPython dictionary 是从 hashable keys 到 values 的可变映射，适合按名称或标识符快速组织和查找数据。python · dict · dictionaryDynamic Signalling HubCancerDynamic signalling hub 是局部多细胞相互作用区域；相邻细胞在其中交换信号，共同塑造 cell state、tissue organization 与疾病行为。cell-cell-communication · tumour-microenvironment · signallingEASIClinicalEASI（Eczema Area and Severity Index）是结合皮损严重程度与受累面积评估 atopic dermatitis 的临床评分。atopic-dermatitis · severity-score · dermatologyEcoTyperOmicsEcoTyper 是从 single-cell 与 bulk transcriptomic data 中识别 cell states 和 multicellular ecotypes 的计算框架。ecotyper · tumour-ecotype · cell-stateFerroptosisCell BiologyFerroptosis 是由铁依赖性 phospholipid peroxidation 驱动的 regulated cell death，最终因膜脂过氧化失控而造成致死性膜损伤。ferroptosis · cell-death · regulated-cell-deathGenesGenomics本页汇总阅读论文时反复出现的 genes，重点记录 canonical function、常见 marker 语境与容易误读之处。gene · marker-gene · tumour-microenvironmentHTML 格式笔记Programming本笔记介绍 HTML 的基本概念、文件用途、常见标签、页面结构、链接与多媒体元素、表单写法，以及它与 CSS、JavaScript 在网页开发中的关系。HTML · Web开发 · 标记语言Immune CellsImmunology机体通过免疫系统中各种效应细胞和分子的共同作用，抵御病原体及其毒素的侵害。固有免疫应答和适应性免疫应答都依赖白细胞的功能；因此理解免疫系统，首先要理解这些细胞从哪里来、在哪里成熟、如何进入血液和组织，以及在免疫应答中承担什么角色。immune-cell · hematopoiesis · leukocyteInflammationImmunologyInflammation 是组织受到感染或损伤后，由 resident cells 与 recruited immune cells 通过 cytokines、chemokines 等介质共同组织的局部反应。inflammation · innate-immunity · cytokineIntraclass Correlation CoefficientStatisticsIntraclass correlation coefficient（ICC）衡量同一 subject 内 repeated measurements 的一致性或可靠性。icc · reproducibility · reliabilityJSON 格式笔记Programming本笔记介绍 JSON 的基本概念、文件用途、语法规则、常见数据类型、嵌套结构、格式化与校验方法，以及在配置文件和数据交换中的典型应用。JSON · 数据格式 · 配置文件MacrophagesImmunology组织里的吞噬与调控细胞。不是单个 marker 能定义的类型，而是一组随组织环境变化的状态集合。macrophage · monocyte · tamMelanomaCancerMelanoma 是来源于 melanocytes 的恶性肿瘤。Melanocytes 是产生 melanin 的色素细胞，主要位于皮肤，也可见于眼、黏膜等部位。melanoma · skin-cancer · tumor-microenvironmentModeling WorkflowStatisticsModeling workflow 是从 raw data 到 validated model 的有序但可迭代过程，涵盖探索、预处理、建模、评估与解释。modeling-workflow · eda · feature-engineeringMulticellular EcosystemCancerMulticellular ecosystem 是由相互作用的 cell types 与 cell states 构成的局部组织单元，它们共同塑造组织功能与疾病行为。tumour-microenvironment · spatial-biology · cell-stateMultiplexed Protein ImagingOmicsMultiplexed protein imaging 在保留组织空间位置的同时测量多个 protein markers，用于解析 cell phenotype 与 spatial neighborhood。multiplexed-imaging · protein-marker · spatial-biologyMyeloid CellsImmunologyMyeloid cells 是来自 myeloid lineage 的免疫细胞集合，包括 monocytes、macrophages、dendritic cells 与 granulocytes 等。myeloid-cell · innate-immunity · macrophageNecroptosisCell BiologyNecroptosis 是主要由 RIPK1、RIPK3 与 MLKL 介导、具有膜破裂特征的 regulated cell death。necroptosis · cell-death · regulated-cell-deathPathogensImmunology免疫系统不是为了“识别一切外来物”而存在，而是为了在病原体及其毒素造成损伤之前，限制、清除或控制它们。理解免疫应答时，先要理解敌人是什么：病原体有哪些类型、它们在哪里复制、大小差异有多大、以什么方式伤害宿主。pathogen · infection · microbiotaPhases of the Immune ResponseImmunologyImmune response 是从快速的 innate defense，到 antigen-specific adaptive activation、effector phase，再到 immune memory 的时间过程。immune-response · innate-immunity · adaptive-immunityPhenotypic VariationCancerPhenotypic variation 指 cells、tissues、tumors 或 individuals 之间可观察的 biological states 与 behaviors 差异。phenotype · heterogeneity · tumour-microenvironmentPreprintMetascience预印本是在正式同行评审前公开发布的研究手稿；arXiv、bioRxiv 与 medRxiv 服务于不同学科，但都让研究结果更早进入公开记录。preprint · arxiv · biorxivPyroptosisCell BiologyPyroptosis 是由 gasdermin 成孔介导的 lytic regulated cell death，典型表现为 membrane pore formation、cell swelling 与炎症介质释放。pyroptosis · cell-death · regulated-cell-deathR PackageProgrammingR package 是按约定组织 R code、metadata、documentation、tests 及可选 data 的可安装软件单元。r · package · reproducibilitySpatial Domain DiscoveryOmicsSpatial domain discovery 是从 spatial omics data 中识别 tissue regions、niches、neighborhoods 或 domains 的计算过程。spatial-domain · niche-discovery · spatial-clusteringSpatial EcoTyperOmicsSpatial EcoTyper 是从 spatially resolved molecular data 中识别并刻画 spatial ecotypes 的 machine-learning framework。spatial-ecotyper · spatial-ecotype · tumour-microenvironmentSpatial TranscriptomicsOmics在保留组织空间位置信息的前提下测量基因表达。spatial-transcriptomics · gene-expression · tissue-organizationStatistical ModelingStatisticsStatistical model 是对数据生成过程或变量关系的数学表达，可用于描述、解释或预测。statistical-model · descriptive-model · inferential-modelSupervised and Unsupervised LearningStatisticsSupervised learning 使用 labeled examples 学习 features 到已知 outcome 的映射；unsupervised learning 则在没有 outcome labels 时寻找数据结构。supervised-learning · unsupervised-learning · regressionTH2ImmunologyTH2 cells 是协调 type 2 immune response 的 CD4+ helper T-cell subset，主要分泌 IL-4、IL-5 与 IL-13。t-cell · type-2-immunity · cytokineTissue OrganizationCancerTissue organization 指 cells、cell states、extracellular structures 与 functional regions 在组织中的空间排列及相互关系。tissue-organization · spatial-biology · tumour-microenvironmentTOML 格式笔记Programming本笔记介绍 TOML 的基本概念、文件用途、键值对语法、表与数组写法、常见配置场景，以及它在 Python 和 Rust 项目配置中的应用。TOML · 数据格式 · 配置文件Tumor MicroenvironmentCancerTumor microenvironment（TME）是 malignant cells 与 immune、stromal、vascular components 及 extracellular matrix 共同构成的局部组织环境。tumor-microenvironment · tme · cancer-biologyVaccinationImmunologyVaccination 通过接种疫苗诱导免疫保护；这个词源自拉丁语 vacca（cow），记录了牛痘、天花与现代免疫学相遇的历史。vaccination · vaccine · smallpoxXML 格式笔记Programming本笔记介绍 XML 的基本概念、文件用途、标签语法、属性与嵌套结构、命名空间、常见应用场景，以及与 JSON、YAML 等数据格式的区别。XML · 数据格式 · 配置文件YAML 格式笔记Programming本笔记介绍 YAML 的基本概念、文件用途、语法规则、缩进层级、列表与字典写法、多行字符串、常见配置场景以及与 JSON 的区别。YAML · 数据格式 · 配置文件期权交易策略：从单腿到组合Finance梳理常见期权交易策略，包括买入看涨、买入看跌、备兑看涨、价差、蝶式和铁鹰策略，并讨论波动率、时间价值与风险管理。期权 · 交易策略 · 风险管理期权基础：概念、类型与风险Finance系统梳理期权的基本定义、Call 与 Put、买卖双方权利义务、核心定价要素、常见用途与主要风险。期权 · 美股 · 金融衍生品美股交易时间：盘前、盘中、盘后与隔夜交易Finance梳理美国股票市场的盘前、常规、盘后与隔夜交易时段，并对照美东时间和北京时间说明不同交易窗口的流动性、波动性与操作注意事项。美股 · 交易时间 · 盘前盘后鸽派、鹰派、左派与右派Political Science梳理鸽派、鹰派、左派与右派四个常见政治经济标签，区分政策态度、政治立场及其在不同语境中的含义。鸽派 · 鹰派 · 左派