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Genomic Analysis
从 GWAS 与分子 QTL 汇总数据出发,进行共定位、SMR 及其他遗传关联信号的整合分析。
2 章 · 2026-04-06 – 2026-04-06
01
使用 coloc 进行共定位分析
整理 GWAS 与 QTL 区域汇总数据,使用 coloc.abf 比较单信号,并在多信号场景中结合 SuSiE 与 LD。
02
使用 SMR 整合 GWAS 与 eQTL
准备 GWAS、eQTL 与 LD reference 数据,运行 summary-data-based Mendelian randomization,并结合 HEIDI 判断异质性。